Nat Biotechnol :深度解读!研究者成功清楚地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2022-02-07 00:09:04 来源:
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据悉,一项刊登在国际月刊Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究工作报告中都会,来自欧洲分子生物学Laboratory等机构的科学家们通过研究工作将本能小肠有机物一组中都会所有已知的病菌等位基因一组汇编成了一个大型的资料库,从而就能想研究工作医护人员深入即使病菌等位基因和亚基两者之间的关联,以及其对本能有益的影响。

病菌遍布新陈代谢系统内均,其很难产生亚基质来影响EVA新陈代谢、有益和对疾病的易感性,其如此普遍以至于新陈代谢系统有机物一组成员的数量要比新陈代谢系统细胞还要多,最主要病菌、真菌和其它有机物;为了理解病菌在本能生物学中都会所反派的关键脚色,科学家们上都会都会在Laboratory中都会复合并对其人才,随后在对病菌顺利完成DNA高通量,然而目前很多病菌还未在Laboratory的环境中都会被人才繁殖。

为了赢得这些病菌的相关反馈,研究工作医护人员作出了另均一种分析方法,他们从环境中都会(比如小肠)获取一般而言采样,随后在对整个采样中都会的DNA顺利完成高通量,然后精心设计分析方法对来自一般而言采样中都会的数千种种群的幼体等位基因一组顺利完成翻修,这种分析方法被特指宏等位基因一组学技术开发,该技术开发能作为一种替代分析方法对单个种群的DNA顺利完成复合和高通量。

研究工作者Rob Finn指出,月份最主要我们在内的三个独立制作组翻修了成千上万个小肠有机物一组等位基因一组,而最小的问题就是这些制作组所得到的结果是否具有一般而言性,以及是否能将这些结果汇编成为一个非常全面的清单。目前研究工作医护人员已经从本能小肠中都会超过4600种病菌群落中都会汇编了20万个等位基因一组和1.7亿个亚基质序列,这种新型的资料库(为统一的本能呼吸道等位基因一组闭包和为统一的呼吸道亚基质清单)揭示了EVA小肠的巨大多样性,并为进一步顺利完成小肠有机物一组研究工作过渡到了路面。

研究工作者绘制出的这个巨大的清单是有机物一组研究工作的一个里程碑,未来或将能为科学家们透过非常宝贵的资源来研究工作本能小肠生态系统中都会每一种病菌所反派的关键脚色。这项研究工作表明,超过70%被检测到的病菌从而在Laboratory中都会被成功人才过,而其在体内的活性仍然未知,而这类病菌中都会最小的群体就是Comantemales;研究工作者指出,见到Comantemales如此广泛感叹一个精彩,这就凸显了我们的确对小肠中都会的病菌相去甚远,我想这个清单能想生物反馈学家和分子生物学家在未来几年补足这一知识空白。

该资料库/清单获取的所有样本都能在该网站资源Mgnify中都会赢得,其能想科学家们归纳有机物的等位基因一组样本并且与这两项的资料库顺利完成对比;随着欧美研究工作制作组慢慢发行新的资料库,该清单可能都会扩大到最主要其它EVA口腔的有机物一组,比如眼部或口腔内部等口腔。最后研究工作者指出,这一清单的汇编未来或为生物化学和临床研究工作医护人员透过非常丰富的资源,然而研究工作医护人员可能都会在南美洲、大洋洲和乌干达等传奇色彩不足的地区断定更多新的病菌种群,目前研究工作医护人员未必可信不同青年人中都会病菌多样性的区别和推移情况。

更早出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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